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RNA多样的生物学功能与其多变的拓扑结构密切关联。无论在细胞外还是在细胞内，对RNA二级结构的检测都是科研的热点。由富鸟嘌呤（G）序列形成的G-四链体结构是其中一种重要的功能性RNA二级结构。日前，科研人员能够运用小分子探针或特异性抗体对细胞内整体的RNA G-四链体结构进行检测。然则，转录组中存在众多的富G序列。由区别富G序列所形成的G-四链体，它们结构类似，但存在、功能与相互功效对象却大不相同。怎样在数量庞大的其他RNA富G序列干扰下，特异性对单一指定富G序列所形成的G-四链体结构进行检测是一大挑战。
近期，中山大学药学院的谭嘉恒副教授与黄志纾教授课题组首次报告了基于杂交技术所设计的新型G-四链体荧光探针——GTFH（G-Quadruplex-Triggered Fluorogenic Hybridization）探针。该类探针由两部分构成，一部分为特异性的小分子G-四链体荧光探针，而另一部分则是能与富G RNA邻近序列进行杂交的DNA分子，两者经过点击化学偶联。科研人员以NRAS mRNA的 5′-UTR富G序列为靶标，设计合成为了能选定对该序列所形成的G-四链体结构进行检测的GTFH探针ISCH-nras1。
应用探针ISCH-nras1，科研人员实现了细胞内NRAS mRNA 5′-UTR中G-四链体结构的有效精确检测。GTFH探针设计合成简便，能够在其他G-四链体结构的检测中推广应用。
该科研成果在《美国化学学会会刊》（Journal of the American Chemical Society）上发布，第1作者是陈硕斌博士。
该科研工作得到了国家自然科学基金和广东省自然科学杰出青年基金的大力支持。
http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jacs.6b04799
原文：Visualization of NRAS RNA G-Quadruplex Structures in Cells with an Engineered Fluorogenic Hybridization  robe
J. Am. Chem. Soc., 2016, 138, 10382-10385, DOI: 10.1021/jacs.6b04799
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发表于 2024-8-4 18:33:55
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