神仙级生信肿瘤数据库运用指南，你不会还不晓得吧？

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相信各位小伙伴们在听过我的生信导学课后，都晓得了生信的核心乃是数据，无数据就好比巧妇难为没米之炊~

尤其是针对分析肿瘤行业的小伙伴们，不但必须丰富的数据来支持自己的各项分析，况且还必须“独特”的数据来彰显自己分析的与众不同。

那样下面博主就给大众带来一个包括人类多个癌症细胞系（即包括基因表达数据、染色体拷贝数据和大规模平行测序数据）的神仙级数据库——CCLE数据库。

CCLE数据库支持操作者在线查找基因在肿瘤细胞系的表达和突变状况，经过对该数据库的灵活运用能够让你的生信分析从更加多维度解释肿瘤中基因表达谱的变化，并且不但是数据丰富，就连其自带的可视化操作工具都能够做到，只必须鼠标简单操作就可分分钟可视化发布级图表。

那样下面就让咱们进行CCLE数据库的仔细诠释吧~

CCLE数据库简介

CCLE数据库全叫作——Cancer Cell Line Encyclopedia即癌症细胞系百科全书，其数据库内包括对上千种癌细胞系的多组学图谱深度解析且于2019年进行更新后，更加是新增了1000多个细胞系的遗传突变、RNA剪接DNA甲基化、组蛋白修饰等关联信息。

不但数据方面非常丰富，就连可视化方面都做得都与前者旗鼓相当，其基因表达数据能可视化为条形图、基因甲基化能够经过气泡图来可视化况且支持在不同细胞系中进行可视化分析，更为要紧的是支持单个细胞系突变数据的在线查看和下载，满足你的一切生信需求，既能够当作数据的丰富源自，又能够分分钟可视化出发布级照片。是你肿瘤分析中的不二选取。

CCLE数据库页面介绍

登录CCLE数据库，点击导航栏中的“about”能够进入about页面，此页面展示的是CCLE数据库的基本数据信息，包含数据数目及种类等等。

点击导航栏“Data”可进入Data页面之后能够查看和下载所要搜索的细胞系或基因组的关联数据，这儿的数据会分为三个模块（博主提示：然则必要登录网才能够查看和下载哦~）

博主划重点~~~，倘若你的分析中想做耐药实验，想对某个靶点进行药品处理，此时候你亦能够运用这个数据库，只必须在某个细胞系中，查找其IC50值，就可做为药品浓度参考（药理学的小伙伴们都惊呆了~）

CCLE数据库核心功能详解（可视化）

俗话说的好“一图胜千言”，优秀的数据结果，倘若无一个优秀的可视化结果岂不是一大憾事！那样接下来就带大众大致认识一下CCLE数据库可视化过程，仔细的学习请参见解螺旋精品单元课哦~

绘制基因表达谱

在检索栏输入基因或细胞系名叫作，以“TP53”为例，点击“Search”，待页面刷新后，可视化结果即立刻呈现（不是吧~居然这么简单）。

敲黑板划重点啦~不但有箱线图，散点图亦能够经过鼠标点点点的操作进行即时可视化哦~

此时候可能有小伙伴会问了，博主，你说这么好的数据库，为何我在以前无重视到呢，是否很少有人运用啊！

面对这类的提问，博主的回答仅有一个“NO~NO~NO”其实有非常多文案都运用了这个数据库，只不外平时的你可能无重视到罢了，下面这篇文案就用了CCLE数据库进行了部分可视化：

倘若觉得影响因子不足高，咱们这儿还有更高的哦~

都看到这儿了，小伙伴们还有理由不去学习这个数据丰富+分分钟可视化发布级照片+高影响因子杂志“红人”的神仙级数据库吗？